Du 17 septembre 2016 au 22 janvier 2017, le Muséum d’histoire naturelle d’Auxerre propose une exposition en deux volets, l’un consacré aux poissons et l’autre intitulée "l’écho des profondeurs" dans le parc du Muséum. Une visite pédagogique est proposée aux enseignants le 21 septembre.
L’Écomusée de la Bresse bourguignonne propose une nouvelle exposition temporaire intitulée Du bois dont on fait les flûtes et bien d’autres instruments, entre le 15 octobre 2016 et le 12 mars 2017. Cette exposition de nombreux instruments de musique du Moyen-âge et de la Renaissance.
A l’occasion du 850e anniversaire de l’arrivée de Thomas Becket à Sens, la commémoration de la présence de l’archevêque de Canterbury dans l’Yonne a lieu jusqu’au 9 janvier 2017. Cette importante figure historique et religieuse est évoquée autour d’un certain nombre d’œuvres et de documents conservés dans des lieux sénonais. Des établissements scolaires s’associent à cet événement en réalisant des parcours de découverte et de médiation culturelles.
Du 2 décembre 2016 au 8 juin 2017, à Longchamp, le lycée Henry Moisand expose une collection de céramiques retraçant un siècle de créations, de la faïencerie traditionnelle au design le plus contemporain. Organisé sur le site même de l’ancienne fabrique léguée par la famille Moisand, cette exposition organisée par l’équipe pédagogique perpétue la tradition de façon exceptionnelle.
Dans le prolongement du festival Migrant’ scène, le lycée Raoul Follereau en partenariat avec la Cimade, propose à ses élèves et à ses étudiants une nouvelle exposition sur le thème des migrants. Cette exposition visible jusqu’au 31 janvier 2017 dans différents lieux de l’établissement est accompagnée de rencontres avec des artistes et des témoins.